尿路感染(UTI)的微生物病原学已被认为是公认的和合理的一致。根据环境(社区vs.医院获得性)、年龄(儿童vs.成人)和性别(女性vs.男性)，病因剂的流行有微小的变化。
细菌可通过以下三种途径侵入并引起尿道感染:提升,血性的,淋巴途径．上升途径是女性最常见的感染途径。血行传播占尿路感染的5%以下，革兰氏阴性杆菌很少发生。
在没有潜在解剖异常、异物或外伤的情况下，多微生物泌尿道感染是罕见的。即使大量存在三种不同的生物体，也表明尿液样本受到了污染。
病因
大肠杆菌
大肠杆菌是社区获得性症状性尿路感染，尤其是膀胱炎的最常见原因。Uropathogenic大肠杆菌(UPEC)仍然是主要的尿路病原体(80%)分离在急性社区获得性无并发症尿路感染。大肠杆菌可通过菌毛附着在尿道和膀胱粘膜上。
金黄色葡萄球菌
金黄色葡萄球菌可引起肾盂肾炎(肾实质感染)。对于细菌血症患者，金黄色葡萄球菌经血行扩散或下行途径到达肾脏。
葡萄球菌saprophyticus
这在年轻女性中很常见。育龄妇女约10%至15%的尿路感染病例是由尿路感染引起的美国saprophyticus。
分枝杆菌
分枝杆菌可导致hiv阳性患者尿路感染。
铜绿假单胞菌
铜绿假单胞菌可导致尿路感染，最常见的患者在医疗保健机构停留时间较长。解剖或神经异常影响尿路或大量抗生素经验的患者也倾向于尿路从铜绿假单胞菌。
Enterococci
罕见引起无并发症的膀胱炎和肾盂肾炎。
其他细菌
其他通常从尿路感染患者中分离出来的细菌有克雷伯氏菌spp。普罗透斯spp。肠杆菌属spp。不动杆菌，枸橼酸杆菌属、乙型溶血性链球菌等。
假丝酵母
假丝酵母在广泛使用抗生素和留置Foley导管的患者中，这种细菌会导致UTI。其他高危患者为糖尿病患者、免疫功能低下患者和免疫抑制治疗患者。
病毒
病毒很少引起尿路感染。腺病毒、BK病毒和巨细胞病毒可引起出血性膀胱炎。这些病毒几乎只会在免疫功能低下的宿主中引起膀胱炎，例如那些经历了干细胞移植的人。
影响病原体流行的因素
UTI的病因也受潜在的宿主因素的影响，使UTI复杂化，如
- 年龄:在无并发症UTI患儿中分离出的最常见的微生物是肠杆菌科．革兰氏阳性菌是常见的，多微生物感染占老年人感染的三分之一。
- 性别:女性比男性更容易受到感染(约40 - 50倍)，因为女性尿道(4厘米)比男性尿道(20厘米)短，即感染因子更容易到达女性膀胱。
- 糖尿病:其中与UTI相关的病原糖尿病患者包括克雷伯氏菌链球菌属、B组链球菌属和肠球菌Spp .，以及大肠杆菌．
- 脊髓损伤或导尿脊髓损伤患者一般有大肠杆菌感染。
复杂UTI与简单UTI:
复杂UTI的病因比非复杂UTI更为多样化，在健康患者中很少引起疾病的生物体可能会在患有解剖、代谢或免疫基础疾病的宿主中引起重大疾病。
治疗尿路感染
治疗任何感染的抗生素选择取决于患者的具体因素(年龄、基础疾病/异常)病原体的局部耐药模式，以及药物的成本和可获得性)。
有几个国家和国际指导方针，帮助选择一个经验方案的尿路感染。关于治疗UTI的抗生素选择，您可以参考2010年IDSA/ESCMID指南(他们更倾向于硝基呋喃妥因、甲氧苄啶-磺胺甲恶唑、磷霉素和pivmecillinam治疗女性无并发症膀胱炎)或您所在国家/医院的当地指南。
用于经验治疗无并发症尿路感染的药物有:
- 环丙沙星:
- 当有可能替代抗生素时，避免使用氟喹诺酮类药物治疗无并发症的尿路感染。
- 如果尿路病原体的局部耐药流行率超过10%，则不应使用氟喹诺酮类药物。
- 呋喃妥英:
- 对于肾功能下降的患者，呋喃妥英仅当局部耐药数据显示对替代药物有高耐药时才应使用。
- 由于肾实质中的药物含量较低，怀疑肾盂肾炎的病例应避免使用呋喃妥因和磷霉素。
- 功效(复方磺胺甲恶唑):如果局部流行尿路病原体耐药，不宜使用(大肠杆菌)超过20%。
疑似肾盂肾炎(腰痛、发热)、男性疑似尿路感染、复发性尿路感染、妊娠、抗生素治疗失败或症状持续时，应送尿液进行培养。